海南食品药品管理职业技能培训中心成立于2001年,是经海南省民政厅、海南省人事劳动保障厅批准成立、从事医药行业人员培训的社会力量办学机构,也是海南省食品药品监督管理局指定的承担医药行业管理相对人培训的唯一一家培训机构。
2003年4月,经海南省人劳厅批准,中心组建了海南省第四十八国家职业技能鉴定所,开展我省医药行业的职业技能鉴定;2004年6月,经海南省教育厅批准,培训中心与中国药科大学成人教育学院联合办学,成立了中国药科大学海南函授辅导站,开展药学本、专科层次的学历教育。2009年3月,经海南省教育厅批准,培训中心成为北京中医药大学远程教育学院及山东大学网络教育学院在海南的学习中心,开展中药学及药学的远程学历教育。